BioCrunch
BioCrunch ist ein zentral verwalteter Hochleistungs-Linux-Cluster, der aus mehreren Netzwerkknoten besteht und von der Zoologischen Staatssammlung betrieben wird. Auf dem Cluster laufen verschiedene Programme, die sich mit der Inferenz von phylogenetischen Bäumen beschäftigen. Der Cluster ist nur für Benutzer mit einem Benutzerkonto zugänglich.
Software
| Software | Default Version | Zusätzliche Versionen |
|---|---|---|
| MrBayes | 3.2.5 | 3.2.2 |
| BEAST | 1.8.2 | 1.6.2, 1.7.1, 1.8.0 |
| BEAST 2 | 2.3.0 | 2.1.0 |
| RAxML | 7.2.8 | 8.2.3 |
| ExaBayes | 1.4.2 | |
| IQ-TREE | 1.3.10 |
Hardware
BioCrunch läuft auf einem 64-Bit-Linux-System. In der Standardkonfiguration läuft der Cluster auf 90 Kernen. Sie können die Anzahl der Kerne und deren aktuelle Nutzung auf der Statusseite sehen. Der Cluster-Controller läuft auf einem AMD Opteron(TM)-Prozessor 6274.